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今天是:2023年08月28日

圖片僅供參考,以實物為準(zhǔn)

  • 名稱:Pippin Prep全自動核酸電泳和片段回收系統(tǒng)
  • 型號:Pippin Prep
  • 品牌:Sage Science
  • 類別:蛋白分析系統(tǒng)
  • 公開報價:請電話咨詢
  • 銷售咨詢:010-63836252

產(chǎn)品詳細(xì)介紹

Pippin Prep全自動核酸電泳和片段回收系統(tǒng)
 
手工切膠DNA回收一直是一項繁瑣且不精確的技術(shù)。隨著高通量測序的廣泛應(yīng)用,希望DNA片段大小回收能夠自動化完成的業(yè)界需求越來越強(qiáng)烈。
 
    Sage Science公司由此開發(fā)出了 Pippin Prep  全自動核酸電泳片段回收儀,高質(zhì)量地完成包括建庫在內(nèi)的多種實驗過程中分離純化各種大小 DNA 片段的需求。
 
產(chǎn)品特點:
>  軟件設(shè)置片段大小范圍,儀器準(zhǔn)確完成分離純化
回收DNA片段直接應(yīng)用于高通量測序文庫構(gòu)建
每一輪只需3-6 分鐘手工操作
一次性預(yù)制膠槽,杜絕交叉污染
 
全自動核酸電泳和片段回收系統(tǒng)技術(shù)原理:
    實驗運(yùn)行中,軟件通過實時光路檢測并比對DNA ladder,確定要回收的DNA片段到達(dá)洗脫泳道(elution channel)的準(zhǔn)確時間。通過電極切換,打開洗脫泳道,使目標(biāo)片段進(jìn)入洗脫通道的回收室中,從而實現(xiàn)回收。
 
操作流程:
一站式操作,簡易直接
> 3-6分鐘的手工時間
無復(fù)雜前處理過程
>回收的樣本可直接進(jìn)行PCR擴(kuò)增,參與下一步實驗。
 
應(yīng)用范圍:
    核酸片段的自動化回收可用于生命科學(xué)的多個方面。對于前沿?zé)狳c之一的高通量測序(next-generation sequence),Pippin Prep為其文庫制備過程中所需的核酸片段回收給出了詳細(xì)解決方案。
 
產(chǎn)品覆蓋范圍: 50 10,000bp.
PE Libraries(配對末端文庫)
>  1.5% (300-1500bp)
>  2%  (100-600bp)
>  2%  不含EB (100-600bp)  
miRNA Libraries(小RNA文庫)
>  3%  (50-300bp)
Mate-pair Libraries(大片段兩端序列文庫)
>  0.75%  (1-10kb) 
ChIP-seq(染色質(zhì)免疫沉淀-深度測序)
>  1.5% and 2% (sealed elution modules設(shè)計, 可用于長時間洗脫)
 
性能優(yōu)越:
Ø       2%預(yù)制膠用于PE文庫構(gòu)建
Pippin Prep基本上避免了小分子量核酸片段的污染,且有更高的回收效率,提升了PE文庫構(gòu)建質(zhì)量。
> 1.5%預(yù)制膠用于PE文庫構(gòu)建
1.5%2%預(yù)制膠均可用于PE文庫構(gòu)建,根據(jù)實際應(yīng)用的高通量測序平臺對回收片段大小的要求來從二者之中進(jìn)行選擇。
  
Ø       3% 預(yù)制膠用于miRNA文庫構(gòu)建
3%預(yù)制膠能有效的將miRNA 文庫和接頭二聚體(adapter dimers)以及大分子量的RNA片段區(qū)分開并且分離純化出來。
 
Ø       1.5%預(yù)制膠用于ChIP-seq文庫構(gòu)建
ChIP應(yīng)用一般要求較寬范圍(broad type)的片段大小回收。Pippin Prep能夠滿足實驗需求。
 
微量基因組DNA樣品中核酸片段的回收
Pippin Prep核酸電泳和片段回收系統(tǒng),和Agilent生物分析儀的高靈敏度芯片聯(lián)用,可以預(yù)先分析微量基因組DNA中的片段長度范圍分布,供用戶選擇合適的核酸片段的回收長度范圍。同時Agilent生物分析儀,也是評估微量微量核酸片段回收產(chǎn)物的一個理想選擇。
 
Agilent生物分析儀上分析Pippin Prep的回收產(chǎn)物。用2% 瓊脂糖凝膠電泳來回收中心位于150bp的緊密分布的核酸片段 (Pippin Prep settings: bptarget = 150). 插圖所示為產(chǎn)物峰值區(qū)域的放大。
 
   因為Agilent生物分析儀的高靈敏度芯片只需ng級的DNA的上樣量,所以它是一個理想的工具,和Pippin Prep自動核酸電泳和片段回收系統(tǒng)聯(lián)用,來分析樣品中核酸片段的長度分布。知道了樣品中核酸片段的長度分布,用戶就可以在Pippin Prep系統(tǒng)上選擇合適的核酸片段長度范圍,因此,能夠增強(qiáng)用戶對核酸片段長度的選擇控制,從而大大地提高文庫構(gòu)建的成功幾率。
    Agilent生物分析儀的高靈敏芯片也是評估Pippin Prep回收產(chǎn)物的一個非常好的選擇,它有足夠的靈敏度來評估基因組DNA中的很窄的長度范圍的片段回收產(chǎn)物。上樣量低達(dá)50ng。
 
通過調(diào)整核酸片段的回收長度范圍來提高回收產(chǎn)量
    Pippin Prep自動化核酸片段選擇和回收系統(tǒng)被設(shè)計用于非常窄的片段分布的gDNA樣品制備。因此,默認(rèn)的“緊密型”片段回收設(shè)置得到的產(chǎn)物的片段長度分布明顯地比傳統(tǒng)方法窄。如果“緊密型”片段回收設(shè)置有時不能夠得到足夠的回收量,用于構(gòu)建文庫。用于可以通過擴(kuò)大片段長度的選擇范圍來大大地提高回收產(chǎn)量。  
  
   把片段長度范圍從80 bp擴(kuò)大到150 bp,回收產(chǎn)量提高3-5倍。這些數(shù)據(jù)表明,如果“緊密型”片段回收設(shè)置不能得到足夠量的產(chǎn)物。用戶可以通過擴(kuò)大核酸片段長度的回收范圍,來大大地提高回收產(chǎn)物量。
 

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